事业单位会计制度是指各类事业单位以货币为主要计量单位，对单位预算资金及经营收支过程和结果进行核算、监督的专业会计，是预算会计的一个重要组成部分。它以实际发生的各项经济业务为对象，记录、反映和监督事业单位预算（年度财务收支计划）执行过程及结果。事业单位会计核算工作必须遵守国家有关法律、法规及准则的规定。事业单位的各项资金和财产均应纳入事业单位会计核算。
国有事业单位的会计组织系统分为主管会计单位、二级会计单位和基层会计单位三级。向同级财政部门领报经费，并发生预算管理关系，下面有所属会计单位的，为主管会计单位；向主管会计单位或上级单位领报经费，并发生预算管理关系，下面有所属会计单位的，为二级会计单位；向上级单位领报经费，并发生预算管理关系，下面没有所属会计单位的，为基层会计单位。以上三级会计单位实行独立会计核算，负责组织管理本部门、本单位的全部会计工作。不具备独立核算条件的，实行单据报账制度，作为“报销单位”管理。
事业单位会计的主要职责是进行会计核算，实行会计监督，参与经济事业计划管理等。其基本任务概括如下。
（1）反映和监督预算财务收支情况，确保国家预算收支任务的顺利实现。事业单位会计要严格执行会计制度，认真做好记账、算账和报账工作，情况要真实可靠，以确保国家预算的编制和各项收支任务的完成。
（2）监督预算执行，检查资金使用情况，提高资金使用效益。事业单位会计应根据事业计划的要求，及时、合理地组织和供应、使用资金，在积极合理组织资金的同时，要合理安排资金支出，正确处理不同来源和不同性质的资金使用，提高资金使用效益。
（3）检查预算收支活动，正确执行国家财经方针、政策。事业单位会计要在反映单位预算的同时，以国家的有关财经政策、法令和制度为依据，严格审核各项预算收支的合理性和合法性，检查预算收支活动，促进增收节支。
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